HDF5DotNet : 文字列の書き込み: プログラムなど個人的メモ

HDF5DotNet : 文字列の書き込み ― 2013年02月08日 08:18

文字列の書き込み方法について
文字列を書き込む方法はちょっと特殊。

基本は前回の"HDF5 : 値の追加"と同じ方法であるが、C#にある"string"型が使用できない。まずは、"string"型を"byte[]"型にして、"byte"型の配列にしてやる。
"string"型を"byte[]"型に変換するには"UTF8Encoding"クラスなどの"GetBytes"メソッドを使用する。

string stringValue = "This is TestString.";
UTF8Encoding uni = new System.Text.UTF8Encoding( );
Byte[] byteArray = uni.GetBytes( stringValue );

まずはSpaceの作成。ここも少し特殊。書き込みは"byte[]"型であるが、文字列ひとつを一つの型と認識させるので、Spaceの定義は以下のようになる。

H5DataSpaceId spaceID = H5S.create_simple( 1, new long[] { 1 } );

続いて型の定義。基本通り"H5DataTypeId"を作成するが、上記に書いた通り、文字列を一つの型と認識させる必要がある。型の大きさを指定する場合は"H5T"クラスの"create"メソッドを使用する。
引数は以下のように
　"createClass" : "H5T.CreateClass"列挙型を指定。
　"size" : int型、型の大きさを指定する。
文字列を書き込む場合は"H5T.CreateClass"列挙に"STRING"があるので、それを使用する。sizeは上記で取得したbyte[]の配列長さを指定する。型の定義は以下のようになる。

H5DataTypeId typeID = H5T.create(H5T.CreateClass.STRING,byteArray.Length );

また、前回の型定義方法でも可能。"H5T"クラス"copy"メソッドで使用する型定義は"C_S1"の列挙型を指定する。定義後はサイズ指定をする必要がある。
サイズを指定する場合は、"H5T"クラスの"setSize"メソッドを使用する。引数は以下の通り。
　"typeId" : "H5DataTypeId"クラス、同じ"H5T"クラスのメソッド"copy"メソッドで作成した型情報を渡す。
　"size" : "int型"、型のサイズを指定する。

H5DataTypeId typeID = H5T.copy( H5T.H5Type.C_S1 );
H5T.setSize( typeID, byteArray.Length );

後は、数値の書き込みと同じように、"H5DataSetId"を作成して、"H5D"クラスの"write<>"メソッドで書き込む。書き込む内容は上記で取得したbyte[]。

H5DataSetId datasetID = H5D.create( fileID, "Test", typeID, spaceID );
H5D.write<byte>( datasetID, typeID, new H5Array<byte>( byteArray ) );

書き込み終了後は、各ID作成クラスにある"close"メソッドで後処理を行う。
ちなみにこの方法で作成すると、HDFViewでlengthが固定になってしまう。HDFViewで編集することもできるが、lengthを超える値を保存しようとすると、超えた部分は保存されない。
以下、サンプルプログラム

H5FileId fileID = H5F.create("C:\\Test.hdf5" , H5F.CreateMode.ACC_TRUNC );
string stringValue = "This is TestString.";
UTF8Encoding uni = new System.Text.UTF8Encoding( );
Byte[] byteArray = uni.GetBytes( stringValue );
H5DataSpaceId spaceID = H5S.create_simple( 1, new long[] { 1 } );
H5DataTypeId typeID = H5T.create( H5T.CreateClass.STRING, byteArray.Length );
H5DataSetId datasetID = H5D.create( fileID, "Test", typeID, spaceID );
H5D.write<byte>( datasetID, typeID, new H5Array<byte>( byteArray ) );
H5D.close( datasetID );
H5T.close( typeID ); 
H5S.close( spaceID );
H5F.close( fileID );

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